В лицее реализуются профили:

-  естественно-научный (физико-математической направленности)

-  технологический (инженерно-математической направленности)               

- социально-экономический (экономико-математической  направленности). 

В  МАОУ лицее «Морской технический» профильные предметы «Алгебра и начала анализа», «Геометрия», «Физика», «Информатика», «Экономика», «Право» - учебные предметы федерального компонента повышенного уровня, обеспечивающие дополнительную (углубленную) подготовку обучающихся.

Все 10 - 11 классы являются профильными.

Профиль 10а класса естественно-научный физико-математической направленности; профильные предметы «Алгебра и начала анализа», «Геометрия», «Информатика», «Физика».

10б класс делится на две группы. 1-ая  группа технологического профиля инженерно-математической направленности, профильные предметы «Алгебра и начала анализа», «Геометрия», «Информатика»,  «Физика». Элективный курс «Информационные технологии» направлен на углубленное изучение учебного предмета «Информатика». 2-ая группа социально-экономического профиля экономико-математической  направленности, профильные предметы «Алгебра и начала анализа», «Геометрия», «Экономика», «Право».

Формой организации профильного обучения в МАОУ лицее «Морской технический» являются профильные классы (как с одним, так и с двумя профилями).